崇祯二年五月，毛文龙做出了他在历史上最后一次警报，他直接向崇祯天子报告，说他已经探听到后金的行动计划，皇太极有意要从蓟门破口入关。毛文龙在奏章中还给出了具体的时间，他认为这次空前的入侵计划大概是在十月中旬左右。
毛文龙在奏章中把后金匪夷所思的计划再次归咎于袁崇焕对他的经济封锁、以及随之而来的东江镇瓦解。
无论是这个历史还是黄石原本的世界，在崇祯元年下半年，明廷都在议论是不是该把东江镇移镇盖州，是不是应该支援东江军直攻辽阳，这个时候后金正龟缩在辽中平原，大概绝对不会有人想到他们竟有一天能突袭关内。
可是袁崇焕开始议和仅仅数月后，东江镇就放弃了百分之九十九的陆地领土，几乎彻底丧失了牵制能力。而后金不出一兵、不发一矢，就夺回了东江镇无数烈士用鲜血换回来的土地，从东到西领土扩大了近三倍，披甲兵也翻了一番。
在历次给辽西的预警中，毛文龙对宁远之战的预测和后金实际出兵时间仅差了一天，宁锦之战则仅差了两天，这次毛文龙对蓟门有险的警报比真正遇险提早了五个月，是算命先生毛文龙一生中最超前的一次预言，不过也是他误差最大的一次。毛文龙预测的时间是十月中旬，而皇太极出兵破口的时间是十一月初二，前后差了有十几天之久。
毛文龙在他发出地最后一次警告中。竭尽全力地向崇祯天子呼吁，请求明廷停止对东江镇的经济封锁，让辽东子弟能够免于饥寒。毛文龙情辞恳切地向皇帝保证说，只要东江军能吃上饭，他们一定会为保卫国家出力的。和黄石原本的历史一样，文臣对毛文龙的这次警报嗤之以鼻，声称这不过是毛文龙讨饷的“故伎”罢了。
幸运、抑或者是大不幸？后金的战车正沿着毛文龙预言地轨道疾驰。五个月后皇太极在毛文龙预言的时间段里、在毛文龙预言地地点进行了第一次对大明腹地的入侵，毛帅虽然已经不在了。但明廷原本还是有机会作出针对性安排的。
幸运、抑或者是大不幸？正是毛文龙用毕生精力与之斗争的敌人，用实际行动证明了：毛文龙直到他生命的最后一刻，还在想着要警告他的祖国，还在想着要为国出力。当毛帅最痛恨的敌寇用蹂躏他祖国腹地地行为来证明他的忠诚时，一直被诬蔑、践踏、讽刺、侮辱的毛帅若是九泉之下有知，他是会痛哭还是会愤怒呢？
……
五月初五，东江岛。
毛文龙收到袁崇焕的信件后，立刻就准备动身离开东江镇本部，前往双岛为自己的部下们讨粮食。
毛承禄、孔有德等人闻讯急忙入大营。最近蒙古各部的谣言传得满天飞，从四月底、闰四月初开始，蒙古各部就不时有人在传说，皇太极给袁崇焕提出的议和条件中包括一条“以文龙首来，方可议和”。
见毛文龙仍要动身去双岛，孔有德焦急地说道：“义父。现在蒙古各部哄传，说袁大人要对您不利，以证明朝廷和建奴议和的决心。”
毛文龙一脸不以为然地神色，满不在乎地说道：“永诗你过虑了，议和这么大的事情，朝廷不点头。袁大人如何能做主？”
“伯父，”毛承禄是毛文龙身边最后一个活着的侄子了，他也发急道：“黄帅前不久还来了好几封密信，要伯父见袁崇焕的时候定要布置刀斧手，以备不测。”
“黄石还是那么荒唐，他一向敌视袁大人，这次估计又听到了什么风声，就担心起我来了。”毛文龙摇头大笑了几声。黄石不惮以最阴暗的想法揣摩袁崇焕的用心，这让毛文龙觉得有些过分了，所以黄石来地那几封信他和几个心腹看完后便都烧掉了。免得给黄石招惹是非。
“吾乃钦差平辽便宜行事挂先锋将军印东江总兵官。赐尚方宝剑、大明太保。”毛文龙说完后傲然抿一抿嘴，对孔有德和毛承禄说道：“我是钦差大臣、总兵官、平辽将军、太保。还有尚方宝剑，没有皇上首肯，谁敢动我一根毫毛？”
孔有德和毛承禄对视了一下，最后还是由孔有德喃喃地说道：“黄帅一次又一次地来信，还是小心一点吧，让袁大人来东江岛好了。”
“不行，这样说不定袁大人就又找到贪污我东江军饷的借口了。”毛文龙叹了口气。
黄石虽然有心帮助东江镇，但他还是没有胆子敢于明目张胆地从福宁镇拨给东江镇军粮。何况就算黄石肯拨，毛文龙还不敢要呢，两个军镇私下进行沟通，这世上决不会有任何一个皇帝能容忍的：“看看我们东江镇吧，每天都有人饿死，我一定要去双岛，我不能给袁大人贪污我们东江军饷的任何借口。”
崇祯二年五月二十五日，袁崇焕从宁远出发，浮海去双岛同毛文龙讨论有关军饷事宜。
在几天的会谈中，袁崇焕反复让毛文龙交出军权，但毛文龙却拒绝私下交出军权。毛文龙认为东江镇乃朝廷所有，他无权把军权私下交给某个人。
六月五日，袁崇焕进行突然袭击，痛斥毛文龙有十二项大罪：
第一，不肯让文官来管理东江镇的钱粮;
第二，八年来从来没有立过任何战功;
第三，奏章上的语气不够恭敬严谨等;
第四，八年来从来没有发给过士兵军饷和粮食;
第五。不**官同意，擅自向天启皇帝请求开马市，和蒙古人卖马也从来不让文官插手;
第六，认了大批干儿子、干孙子，总数超过千人;
第七，欺骗商人钱货，欠账不还;
第八。生性好色;
第九，不给辽民吃饱饭。导致无数人饿死;
第十，瞒过天下人的耳目，在一个不为人知地岛屿上偷偷给魏忠贤立生祠;
第十一，曾经在战报上吹过牛，掩败为胜;
第十二，八年来从来没有收复过一寸土地，浪费国家粮食还观望养敌。
说完十二项大罪后袁崇焕就向北京方向叩拜。表示他要遵从圣旨把毛文龙立刻斩首。毛文龙听闻是皇帝的旨意后，面冲北京方向而跪，束手就戮而没有进行任何反抗。
杀完毛文龙以后，东江众将抚尸痛哭，岛上兵丁汹汹。袁崇焕觉得这样可能不利于自己地形象，就在第二天主持了对毛文龙地祭奠仪式。在祭奠仪式上袁崇焕声泪俱下地大哭了一场，难过得瘫在地上半天都站不起来。袁崇焕把一切罪责都推给了崇祯天子——那个无限信任他的少年，他声称自己昨天杀毛文龙乃是“奉旨行事”。是“国家大法”，而今天自己大哭一场，乃是“同僚私情”。